一、gzip解壓NR庫的時候，報錯格式違法的解決方法

1、檢查NR庫文件是否下載正確

NR 庫文件應(yīng)該是 gz 格式的，如果文件格式不正確，會導(dǎo)致解壓失敗。檢查一下下載的 NR 庫文件是否正確。如果不正確，嘗試重新下載。

2、使用工具比對文件校驗和值是否相同

文件在傳輸或下載過程中可能會發(fā)生損壞，也可能導(dǎo)致解壓失敗。嘗試重新下載 NR 庫文件，或者下載同樣的文件來比較校驗結(jié)果。在下載 NR 庫文件之后，可以使用 MD5 校驗和工具或 SHA1 校驗和工具來比對文件校驗和值是否相同。

3、確認解壓命令的正確性

如果下載的 NR 庫文件沒有問題，則應(yīng)該確認解壓命令的正確性。在解壓命令中指定正確的參數(shù)，例如 “-d” 告訴 gzip 解壓縮源文件并將解壓縮的文件放入目標目錄中。

二、Linux gzip命令

1、簡介

Linux gzip命令用于壓縮文件。gzip是個使用廣泛的壓縮程序，文件經(jīng)它壓縮過后，其名稱后面會多出”.gz”的擴展名。

2、語法

gzip [-acdfhlLnNqrtvV][-S <壓縮字尾字符串>][-<壓縮效率>][--best/fast][文件...] 或 gzip [-acdfhlLnNqrtvV][-S <壓縮字尾字符串>][-<壓縮效率>][--best/fast][目錄]

參數(shù)：

-a或–ascii：使用ASCII文字模式。-c或–stdout或–to-stdout：把壓縮后的文件輸出到標準輸出設(shè)備，不去更動原始文件。-d或–decompress或—-uncompress：解開壓縮文件。-f或–force：強行壓縮文件。不理會文件名稱或硬連接是否存在以及該文件是否為符號連接。-h或–help：在線幫助。-l或–list：列出壓縮文件的相關(guān)信息。-L或–license：顯示版本與版權(quán)信息。-n或–no-name：壓縮文件時，不保存原來的文件名稱及時間戳記。-N或–name：壓縮文件時，保存原來的文件名稱及時間戳記。-q或–quiet：不顯示警告信息。-r或–recursive：遞歸處理，將指定目錄下的所有文件及子目錄一并處理。-S<壓縮字尾字符串>或—-suffix<壓縮字尾字符串>：更改壓縮字尾字符串。-t或–test：測試壓縮文件是否正確無誤。-v或–verbose：顯示指令執(zhí)行過程。-V或–version：顯示版本信息。-<壓縮效率>：壓縮效率是一個介于1－9的數(shù)值，預(yù)設(shè)值為”6″，指定愈大的數(shù)值，壓縮效率就會愈高。–best：此參數(shù)的效果和指定”-9″參數(shù)相同。–fast：此參數(shù)的效果和指定”-1″參數(shù)相同。

3、實例

壓縮文件：

[root@runoob.com a]# ls //顯示當(dāng)前目錄文件a.c b.h d.cpp[root@runoob.com a]# gzip * //壓縮目錄下的所有文件[root@runoob.com a]# ls //顯示當(dāng)前目錄文件a.c.gz????b.h.gz????d.cpp.gz[root@runoob.com a]# 

接范例1，列出詳細的信息：

[root@runoob.com a]# gzip -dv * //解壓文件，并列出詳細信息a.c.gz:???? 0.0% -- replaced with a.cb.h.gz:???? 0.0% -- replaced with b.hd.cpp.gz:???? 0.0% -- replaced with d.cpp[root@runoob.com a]# 

接范例1，顯示壓縮文件的信息：

[root@runoob.com a]# gzip -l *     compressed    uncompressed ratio uncompressed_name         24          0  0.0% a.c         24          0  0.0% b.h         26          0  0.0% d.cpp

延伸閱讀1：NR庫是什么

NR(Non-Redundant Protein Sequence Database)非冗余蛋白庫，所有GenBank+EMBL+DDBJ+PDB中的非冗余蛋白序列，對于所有已知的或可能的編碼序列，NR記錄中都給出了相應(yīng)的氨基酸序列（通過已知或可能的讀碼框推斷而來）以及專門蛋白數(shù)據(jù)庫中的序列號。NR庫相當(dāng)于一個以核酸序列為基礎(chǔ)的交叉索引，將核酸數(shù)據(jù)和蛋白數(shù)據(jù)聯(lián)系起來。